ScholarGate
Assistant

Yapay Zekâ

112 méthodes dans cette famille.

À la une

Parcours de lecture

Les méthodes fondamentales les plus citées de ce thème, dans l'ordre de leur développement — un point de départ si vous débutez ici.

  1. Analyse des variations du nombre de copies1998–2006par Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
  2. Analyse d'enrichissement de voies2003–2005par Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
  3. Analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)par Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
  4. Étude d'association pangénomique (GWAS)2005–2007par Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
  5. Étude d'association pangénomique épigénétique (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)par Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
  6. Analyse de l'expression différentielle par RNA-seq2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)par Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
  7. Analyse de l'ARN-seq unicellulaire2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016par Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
  8. Appel de variants2009–2010 (modern high-throughput era)par Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
toutes les méthodes de ce rayon ↓

Toutes les méthodes 112

Analyse d'admixtureReconstruction de l'état ancestralAnalyse ATAC-seqAppel de pics ChIP-seqThéorie coalescenteAnalyse des variations du nombre de copiesAnalyse d'écran CRISPRReconstruction par cryo-MEAssemblage de novo de transcriptomesAppel de pics différentiels par ChIP-seqAnalyse différentielle des variations du nombre de copiesÉtude différentielle d'association à l'échelle de l'épigénomeAnalyse différentielle des eQTLAnalyse Métabolomique DifférentielleAnalyse d'enrichissement différentiel de voiesAnalyse Protéomique DifférentielleAnalyse différentielle de l'ARN-seq unicellulaireAppel différentiel de variantsÉtude d'association pangénomique épigénétique (EWAS)Étude d'association pangénomique de l'épigénome dans la recherche en éducationAnalyse des QTL d'expressionStatistiques F (FST)GCTAAnalyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA)Étude d'association pangénomique (GWAS)Étude d'association pangénomique en recherche sur l'éducationAnalyse Hi-CTest HKARecherche de profils HMMERModélisation par homologieCartographie par identité par descendance (IBD)Analyse des blocs de déséquilibre de liaisonDétection de pics ChIP-seq assistée par apprentissage automatiqueMachine learning-assisted copy number variation analysisMachine learning-assisted epigenome-wide association studyAnalyse d'eQTL assistée par apprentissage automatiqueAnalyse d'enrichissement de jeux de gènes assistée par apprentissage automatiqueGWAS assisté par apprentissage automatiqueAnalyse métabolomique assistée par apprentissage automatiqueAnalyse de la diversité du microbiome assistée par apprentissage automatiqueAnalyse d'enrichissement de voies assistée par apprentissage automatiqueAnalyse phylogénétique assistée par apprentissage automatiqueMachine learning-assisted RNA-seq differential expressionAlignement de séquences assisté par apprentissage automatiqueAnalyse de l'ARN monocellulaire assistée par apprentissage automatiqueAppel de variants assisté par apprentissage automatiqueTest de McDonald-KreitmanAnalyse métabolomiqueBinning métagénomiqueDockage moléculaireÉtude d'association pangénomique multi-omique de l'épigénomeAnalyse eQTL multi-omiqueAnalyse d'enrichissement de jeux de gènes multi-omiquesAnalyse multi-omique de la métabolomiqueAnalyse de la diversité du microbiome multi-omiqueAnalyse d'enrichissement de voies multi-omiquesAnalyse phylogénétique multi-omiqueAnalyse protéomique multi-omiqueAnalyse de l'expression différentielle multi-omique par RNA-seqAnalyse multi-omique de cellules uniques par ARNmAnalyse des variations du nombre de copies basée sur les réseauxNetwork-based epigenome-wide association studyAnalyse des eQTLs basée sur les réseauxGWAS basé sur les réseauxAnalyse métabolomique basée sur les réseauxAnalyse de la diversité du microbiome basée sur les réseauxAnalyse d'enrichissement de voies basée sur les réseauxAnalyse phylogénétique basée sur les réseauxAnalyse différentielle d'expression de données RNA-seq basée sur les réseauxAnalyse de l'ARNseq unicellulaire basée sur les réseauxAppel de variants basé sur un réseauAnalyse d'enrichissement de voiesModélisation de pharmacophoresAnalyse phylogénétiqueContrôles Indépendants PhylogénétiquesScore de risque polygéniqueTopologie de réseau d'interactions protéine-protéineAnalyse ProtéomiqueQSARCartographie des QTLVitesse de l'ARNAnalyse de l'expression différentielle par RNA-seqBalayage sélectif (D de Tajima)Alignement de séquencesAppel de pics ChIP-seq unicellulaireAnalyse des variations du nombre de copies unicellulairesÉtude d'association pangénomique épigénétique unicellulaire (scEWAS)Analyse eQTL unicellulaireAnalyse d'enrichissement de jeux de gènes unicellulaireGWAS à cellule uniqueAnalyse du métabolisme à l'échelle de la cellule uniqueAnalyse de la diversité du microbiome à l'échelle unicellulaireAnalyse phylogénétique unicellulaireAnalyse de l'ARN-seq unicellulaireAnalyse d'expression différentielle de l'ARNseq à cellule uniqueAlignement de séquences unicellulairesAppel de variants à l'échelle unicellulaireAppel de pics ChIP-seq en séries temporellesAnalyse de la variation du nombre de copies dans le tempsÉtude d'association épigénomique sur séries temporellesAnalyse eQTL en séries chronologiquesAnalyse d'enrichissement de jeux de gènes en séries temporellesAnalyse métabolomique en séries temporellesAnalyse de la diversité du microbiome en séries chronologiquesAnalyse d'enrichissement de voies temporellesAnalyse phylogénétique de séries temporellesAnalyse protéomique de séries temporellesAnalyse d'expression différentielle de l'ARNseq en série temporelleAnalyse de l'ARN séquentiel de cellules uniquesAppel de variants en série temporelleTest de déséquilibre de transmissionAppel de variants

Plus dans Sciences de la vie