Appel de variants à l'échelle unicellulaire — détection de mutations à la résolution cellulaire
L'appel de variants à l'échelle unicellulaire est un pipeline bioinformatique qui identifie les variants de séquence d'ADN — variants mononucléotidiques (SNV), petites insertions et délétions, et altérations du nombre de copies — au sein de cellules individuelles plutôt qu'à travers un mélange de tissus en vrac. En résolvant le paysage mutationnel cellule par cellule, il révèle l'hétérogénéité intratumorale, l'architecture clonale et les schémas de mutation somatique que le séquençage en vrac occulte. L'approche est centrale pour la génomique du cancer, la biologie du développement et toute étude où la diversité génétique intercellulaire est la question principale.
Lire la méthode complète
Connectez-vous avec un compte gratuit pour lire cette section.
Carte des méthodes
Le voisinage des méthodes apparentées — sélectionnez un nœud pour explorer.
Sources
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Quelle méthode ?
Placez cette méthode aux côtés de ses plus proches parentes et lisez-les côte à côte — la bibliothèque pose les ouvrages sur la table ; le choix vous revient.
- Analyse des variations du nombre de copiesBio-informatique↔ comparer
Référencée par
Une erreur sur cette page ? Signalez-la ou proposez une correction →