Analyse de l'ARN séquentiel de cellules uniques — Transcriptomique temporelle à résolution unicellulaire
L'analyse de l'ARN séquentiel de cellules uniques capture l'expression génique à travers de multiples points temporels à résolution unicellulaire afin de révéler comment les populations cellulaires émergent, se transforment et divergent au cours de processus biologiques dynamiques tels que le développement, la différenciation ou la progression de la maladie. En combinant l'ordonnancement par pseudodurée, la vitesse de l'ARN et les tests de dynamique différentielle, les chercheurs reconstruisent la trajectoire temporelle des cellules individuelles et identifient les changements de régulation génique qui pilotent les transitions biologiques.
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Sources
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
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- Analyse des variations du nombre de copiesBio-informatique↔ comparer
- Analyse des QTL d'expressionBio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA)Bio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de voiesBio-informatique↔ comparer
- Analyse de l'expression différentielle par RNA-seqBio-informatique↔ comparer
- Analyse de l'ARN-seq unicellulaireBio-informatique↔ comparer
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