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GWAS basé sur les réseaux — Étude d'association pangénomique basée sur les réseaux

GWAS basé sur les réseaux intègre les résultats de l'étude d'association pangénomique conventionnelle avec des données de réseaux biologiques — tels que les réseaux d'interaction protéine-protéine (IPP) ou les graphes de coexpression génique — pour identifier des modules géniques ou des sous-réseaux pertinents pour la maladie. Au lieu de rapporter uniquement les SNP individuels les plus significatifs, cette approche propage les signaux d'association à travers les réseaux d'interaction moléculaire, faisant émerger des groupes de gènes dont le signal collectif les implique dans la biologie des traits complexes, même lorsqu'aucun variant unique n'atteint la significativité pangénomique à lui seul.

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Sources

  1. Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link
  2. Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/network-based-gwas

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ScholarGateNetwork-based GWAS (Network-based Genome-Wide Association Study). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/network-based-gwas · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026