Analyse d'expression différentielle de l'ARNseq en série temporelle — Transcriptomique temporelle

L'analyse d'expression différentielle de l'ARNseq en série temporelle identifie les gènes dont les niveaux d'expression varient systématiquement au cours de points temporels ordonnés — par exemple, lors du développement, de la progression d'une maladie ou de la réponse à un traitement. Contrairement à l'analyse ED à deux conditions, elle modélise explicitement la structure temporelle des données, capturant les trajectoires dynamiques d'expression génique plutôt qu'un simple contraste instantané. Des outils tels que maSigPro, ImpulseDE2 et splineTimeR ont été développés spécifiquement pour cette conception.