Analyse de l'ARNseq unicellulaire basée sur les réseaux
L'analyse de l'ARNseq unicellulaire basée sur les réseaux étend les flux de travail standard de l'ARNseq unicellulaire en construisant et en interrogeant des réseaux d'interaction moléculaire — réseaux de régulation génique, réseaux de co-expression, ou graphes de communication intercellulaire — à partir de données transcriptomiques unicellulaires. Plutôt que de traiter chaque gène indépendamment, cette approche capture l'activité coordonnée des circuits géniques et des voies de signalisation intercellulaires au sein et entre les populations cellulaires, permettant une vue au niveau du système de la régulation transcriptionnelle à résolution unicellulaire.
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Sources
- Aibar, S., González-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., ... & Aerts, S. (2017). SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083–1086. link ↗
- Jin, S., Guerrero-Juarez, C. F., Zhang, L., Chang, I., Ramos, R., Kuan, C. H., ... & Nie, Q. (2021). Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat. Nature Communications, 12(1), 1088. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/network-based-single-cell-rna-seq-analysis
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