GCTA
GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) est une boîte à outils computationnelle permettant d'estimer l'héritabilité et les corrélations génétiques à partir de données de génotype et de phénotype à l'échelle du génome. Développé par Yang et Visscher en 2011, GCTA utilise le maximum de vraisemblance restreint à l'échelle du génome (GREML) pour partitionner la variance phénotypique en composantes expliquées par les polymorphismes nucléotidiques (SNP) communs, les facteurs environnementaux et la variation résiduelle. GCTA est devenu un outil standard pour comprendre la proportion de la variation des traits attribuable à la génétique à travers les maladies complexes et les traits quantitatifs.
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Sources
- Yang, J., Lee, S. H., Goddard, M. E., & Visscher, P. M. (2011). GCTA: A tool for genome-wide complex trait analysis. American Journal of Human Genetics, 88(1), 76–82. DOI: 10.1016/j.ajhg.2010.11.011 ↗
- Zhou, X., Stephens, M. (2012). Genome-wide efficient mixed-model analysis for association studies. Nature Genetics, 44(7), 821–824. DOI: 10.1038/ng.2310 ↗
- Pitchford, W. S., & Brown, W. M. (2019). Genomic prediction and selection of genomic variance. Genetics Selection Evolution, 51(1), 53–66. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Genome-wide Complex Trait Analysis for Heritability Estimation. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/genetics/gcta
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