Analyse d'enrichissement de voies basée sur les réseaux
L'analyse d'enrichissement de voies basée sur les réseaux intègre les réseaux d'interaction moléculaire — interactions protéine-protéine, graphes de signalisation ou réseaux de régulation génique — avec des mesures omiques pour identifier les voies biologiques qui sont altérées de manière coordonnée dans une condition donnée. Contrairement aux approches classiques de surreprésentation ou d'enrichissement d'ensembles de gènes qui traitent les gènes des voies comme des listes indépendantes, cette famille de méthodes propage les signaux à travers les arêtes du réseau, capturant la topologie des interactions et révélant des modules dérégulés que l'enrichissement par liste plate ne détecterait pas.
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Sources
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
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- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA)Bio-informatique↔ comparer
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