Analyse d'écran CRISPR
L'analyse d'écran CRISPR traite les données issues d'écrans génétiques groupés utilisant CRISPR-Cas9 pour identifier les gènes requis pour la croissance, la survie ou un phénotype cellulaire dans des conditions spécifiques. Développé par Zhang, Sanjana et d'autres, ce pipeline computationnel transforme les lectures de séquençage des abondances d'ARN guides en listes classées de gènes fonctionnels.
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Sources
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/crispr-screen-analysis
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