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Étude d'association pangénomique épigénétique unicellulaire (scEWAS)

Une étude d'association pangénomique épigénétique unicellulaire (scEWAS) interroge les marques épigénétiques — principalement la méthylation de l'ADN ou l'accessibilité de la chromatine — sur l'ensemble du génome à une résolution unicellulaire, puis associe statistiquement la variation de ces marques à un phénotype, une maladie ou une exposition. En résolvant l'hétérogénéité des types cellulaires que les EWAS en vrac ne peuvent séparer, les scEWAS identifient des signaux épigénétiques spécifiques à des populations cellulaires rares ou mélangées plutôt qu'à des moyennes tissulaires.

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Étude d'association pang…Appel de pics ChIP-seq u…Analyse des variations d…

Sources

  1. Zhang, Y., et al. (2022). Single-cell epigenome analysis reveals age-associated decay of heterochromatin domains in excitatory neurons in the mouse brain. Cell Research, 32(1), 1-18. link
  2. Aryee, M. J., et al. (2014). Minfi: a flexible and comprehensive Bioconductor package for the analysis of Infinium DNA methylation microarrays. Bioinformatics, 30(10), 1363-1369. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu049

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-epigenome-wide-association-study

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ScholarGateSingle-cell epigenome-wide association study (Single-Cell Epigenome-Wide Association Study). Consulté le 2026-06-17 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-epigenome-wide-association-study · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026