Process / pipelineBioinformatics / omics

Appel de pics ChIP-seq unicellulaire — Profilage épigénomique scChIP-seq

L'appel de pics ChIP-seq unicellulaire est un pipeline bioinformatique qui identifie les régions génomiques enrichies en modifications d'histones ou en liaison de facteurs de transcription dans des cellules individuelles. En profilant les états de la chromatine à résolution unicellulaire, il révèle l'hétérogénéité épigénomique masquée dans les expériences ChIP-seq en masse, permettant aux chercheurs de cartographier les paysages régulateurs à travers des populations cellulaires distinctes au sein d'un échantillon de tissu complexe.

Ouvrir dans MethodMindBientôtVidéoBientôtDownload slides

Lire la méthode complète

Réservé aux membres

Connectez-vous avec un compte gratuit pour lire cette section.

Se connecter

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Sources

  1. Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link
  2. Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateSingle-cell ChIP-seq peak calling (Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026