Analyse phylogénétique de séries temporelles — Phylogénétique temporelle

L'analyse phylogénétique de séries temporelles reconstitue l'histoire évolutive d'organismes ou de variants génétiques en utilisant des séquences échantillonnées à des points temporels connus. En intégrant directement les dates d'échantillonnage dans le modèle, elle estime les temps de divergence, les taux de substitution et les relations ancestrales sur une échelle de temps absolue, ce qui la rend essentielle pour l'étude des épidémies virales, de la dynamique de l'ADN ancien et de l'évolution microbienne rapide.