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Analyse eQTL en séries chronologiques — Régulation génétique dynamique de l'expression génique

L'analyse eQTL en séries chronologiques identifie les variants génétiques (eQTL) dont l'effet sur l'expression génique varie au cours du temps ou à travers les stades de développement. En combinant des données RNA-seq longitudinales avec les génotypes individuels, la méthode capture comment le même SNP peut activer, silencer ou remodeler la régulation génique à différents moments — révélant l'architecture temporelle du programme régulateur du génome dans des processus tels que la différenciation, la progression des maladies et la réponse environnementale.

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Sources

  1. Fair, B. J., et al. (2020). Gene expression variability in human and chimpanzee populations share common determinants. eLife, 9, e59929. link
  2. Strober, B. J., et al. (2019). Dynamic genetic regulation of gene expression during cellular differentiation. Science, 364(6447), 1287–1290. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis

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ScholarGateTime-series eQTL analysis (Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026