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Analyse de la diversité du microbiome à l'échelle unicellulaire

L'analyse de la diversité du microbiome à l'échelle unicellulaire résout la composition et l'hétérogénéité fonctionnelle des communautés microbiennes au niveau de cellules individuelles ou de bactéries. En combinant l'isolement unicellulaire ou de bactérie unique avec le séquençage à haut débit, ce pipeline surmonte l'effet de moyennage de la métagénomique globale, permettant la détection de souches rares, de variations intra-espèces et de l'hétérogénéité intercellulaire au sein de microbiomes complexes tels que l'intestin, la cavité buccale ou les échantillons environnementaux.

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Analyse de la diversité…Analyse de l'ARN-seq uni…Appel de variants à l'éc…

Sources

  1. Kehe, J., Kulesa, A., Ortiz, A., Ackerman, C. M., Thakku, S. G., Sellers, D., Bhatt, S., ... & Blainey, P. C. (2019). Massively parallel screening of synthetic microbial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(26), 12804-12809. link
  2. Zheng, W., Zhao, S., Yin, Y., Zhang, H., Needham, D. M., Evans, E. D., Bhatt, S., ... & Bhatt, D. L. (2020). High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science, 376(6597), eabm1483. link

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-microbiome-diversity-analysis

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ScholarGateSingle-cell Microbiome Diversity Analysis (Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-microbiome-diversity-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026