Analyse de la variation du nombre de copies dans le temps
L'analyse de la variation du nombre de copies (VNC) dans le temps est un pipeline computationnel de génomique qui caractérise les gains et les pertes chromosomiques à travers plusieurs échantillons séquentiels du même individu ou de la même tumeur. En comparant les profils de nombre de copies à des points temporels successifs — tels que le diagnostic, le milieu du traitement, la rechute — il reconstruit la dynamique clonale et les trajectoires évolutives qui pilotent l'instabilité du génome, permettant aux chercheurs de suivre comment les sous-populations se développent, se contractent ou acquièrent de nouvelles aberrations au fil du temps.
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Sources
- Dentro, S. C., et al. (2021). Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes. Cell, 184(8), 2239-2254. link ↗
- Zaccaria, S., & Raphael, B. J. (2020). Accurate quantification of copy-number aberrations and whole-genome duplications in multi-sample tumor sequencing data. Nature Communications, 11(1), 4301. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/time-series-copy-number-variation-analysis
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- Analyse des variations du nombre de copiesBio-informatique↔ comparer
- Étude d'association pangénomique (GWAS)Bio-informatique↔ comparer
- Analyse de l'expression différentielle par RNA-seqBio-informatique↔ comparer
- Analyse des variations du nombre de copies unicellulairesBio-informatique↔ comparer
- Appel de variantsBio-informatique↔ comparer
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