Analyse de la diversité du microbiome multi-omique
L'analyse de la diversité du microbiome multi-omique intègre deux couches de données omiques ou plus — telles que la métagénomique, la métatranscriptomique, la métabolomique et la métaprotéomique — pour caractériser à la fois la composition et l'activité fonctionnelle des communautés microbiennes. En reliant les métriques de diversité taxonomique aux données de phénotype moléculaire, l'approche révèle comment la structure de la communauté se traduit en fonctions écologiques et pertinentes pour l'hôte qu'aucune couche omique seule ne peut révéler.
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Sources
- Rohart, F., Gautier, B., Singh, A., & Le Cao, K.-A. (2017). mixOmics: An R package for 'omics feature selection and multiple data integration. PLOS Computational Biology, 13(11), e1005752. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1005752 ↗
- Argelaguet, R., Velten, B., Arnol, D., Dietrich, S., Zenz, T., Marioni, J. C., Buettner, F., Huber, W., & Stegle, O. (2018). Multi-Omics Factor Analysis — a framework for unsupervised integration of multi-omics data sets. Molecular Systems Biology, 14(6), e8124. DOI: 10.15252/msb.20178124 ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/multi-omics-microbiome-diversity-analysis
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- Analyse métabolomiqueBio-informatique↔ comparer
- Analyse multi-omique de la métabolomiqueBio-informatique↔ comparer
- Analyse de la diversité du microbiome basée sur les réseauxBio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de voiesBio-informatique↔ comparer
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