Analyse d'enrichissement de jeux de gènes multi-omiques
L'analyse d'enrichissement de jeux de gènes multi-omiques (multi-omics GSEA) est un pipeline computationnel qui applique la logique GSEA simultanément à deux ou plusieurs couches de mesures moléculaires — telles que la transcriptomique, la protéomique et la métabolomique — afin d'identifier les voies biologiques ou les jeux de gènes qui sont co-régulés de manière anormale à travers les plateformes omiques. En intégrant les signatures moléculaires classées de chaque couche, elle révèle une convergence au niveau des voies qu'aucune plateforme omique seule ne pourrait détecter.
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Sources
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Meng, C., Zeleznik, O. A., Thallinger, G. G., Kuster, B., Gholami, A. M., & Culhane, A. C. (2016). Dimension reduction techniques for the integrative analysis of multi-omics data. Briefings in Bioinformatics, 17(4), 628–641. DOI: 10.1093/bib/bbv108 ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Multi-Omics Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/multi-omics-gene-set-enrichment-analysis
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