Analyse d'enrichissement de jeux de gènes assistée par apprentissage automatique
L'analyse d'enrichissement de jeux de gènes assistée par apprentissage automatique (ML-GSEA) étend le cadre classique de la GSEA en intégrant des modèles d'apprentissage automatique supervisés ou non supervisés — tels que les forêts aléatoires, les réseaux neuronaux ou les architectures d'apprentissage profond — pour améliorer la détection, le classement et l'interprétation biologique des jeux de gènes enrichis à partir de données d'expression à haut débit. L'approche est particulièrement précieuse pour les relations complexes et non linéaires entre jeux de gènes que les statistiques d'enrichissement classiques peuvent manquer.
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Sources
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Ma, J., Yu, M. K., Fong, S., Ono, K., Sage, E., Demchak, B., Sharan, R., & Ideker, T. (2018). Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell. Nature Methods, 15(4), 290–298. DOI: 10.1038/nmeth.4627 ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Machine Learning-Assisted Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/machine-learning-assisted-gene-set-enrichment-analysis
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- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes (GSEA)Bio-informatique↔ comparer
- Analyse d'enrichissement de jeux de gènes basée sur les réseauxBio-informatique↔ comparer
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- Analyse de l'expression différentielle par RNA-seqBio-informatique↔ comparer
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