Analyse différentielle de l'ARN-seq unicellulaire

L'analyse différentielle de l'ARN-seq unicellulaire (scRNA-seq) est une chaîne de traitement computationnelle qui compare les profils transcriptomiques entre différentes conditions biologiques — telles que traité versus non traité, maladie versus sain, ou différents points temporels — à une résolution unicellulaire. Elle identifie quels gènes, types cellulaires et états cellulaires changent entre les conditions, fournissant ainsi des informations mécanistiques que les comparaisons d'ARN-seq en vrac ne peuvent offrir. L'approche combine le regroupement (clustering), l'annotation des types cellulaires et les tests statistiques, utilisant typiquement l'agrégation pseudobulk pour tenir compte de la corrélation intra-échantillon.