Analyse d'enrichissement de voies temporelles — Activité dynamique des voies au fil du temps
L'analyse d'enrichissement de voies temporelles identifie les voies biologiques dont l'activité coordonnée des gènes change significativement à travers des points temporels ordonnés. Plutôt que de traiter chaque point temporel indépendamment, la méthode modélise la trajectoire temporelle de l'expression génique au sein de chaque voie et teste si des programmes biologiques entiers — pas seulement des gènes individuels — sont activés ou supprimés d'une manière dépendante du temps. Elle est largement utilisée en biologie du développement, dans les études de réponse aux médicaments et pour les suivis temporels d'infections.
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Sources
- Ernst, J., Nau, G. J., & Bar-Joseph, Z. (2005). Clustering short time series gene expression data. Bioinformatics, 21(Suppl 1), i159–i168. link ↗
- Cheng, J., Tegge, A. N., & Bhatt, D. L. (2014). A method for identifying and interpreting time-series pathway activity changes from gene expression data. Bioinformatics, 30(21), 3147–3154. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/time-series-pathway-enrichment-analysis
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- Analyse d'enrichissement de voies multi-omiquesBio-informatique↔ comparer
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- Analyse de l'expression différentielle par RNA-seqBio-informatique↔ comparer
- Analyse d'expression différentielle de l'ARNseq en série temporelleBio-informatique↔ comparer
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