Process / pipelineSingle-cell genomics

Vitesse de l'ARN

La vitesse de l'ARN (RNA velocity) est une méthode computationnelle qui déduit l'état développemental futur de cellules individuelles à partir de données de séquençage d'ARN unicellulaire. Développée par La Manno et ses collègues en 2018, l'analyse de la vitesse de l'ARN mesure la direction et le rythme des transitions d'état cellulaire en analysant le rapport des transcrits d'ARN messager (ARNm) non épissés sur épissés au sein de cellules individuelles. Ceci permet de prédire les trajectoires cellulaires et les voies de différenciation sans nécessiter d'échantillonnage temporel ou de manipulation, fournissant des aperçus uniques sur les décisions de destin cellulaire pendant le développement et la maladie.

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Sources

La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/genetics/rna-velocity

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