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Analyse de l'ARN-seq unicellulaire — scRNA-seq

L'analyse du séquençage de l'ARN unicellulaire (scRNA-seq) caractérise l'expression génique à la résolution des cellules individuelles, permettant la découverte de types cellulaires, d'états et de transitions invisibles en transcriptomique en vrac. À partir des lectures de séquençage brutes, le flux de travail produit une matrice de comptage cellule par gène et procède au contrôle qualité, à la normalisation, à la réduction de dimensionnalité, au regroupement non supervisé, à l'annotation des types cellulaires et à une gamme d'analyses en aval telles que l'inférence de trajectoire et l'expression différentielle entre les populations cellulaires.

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Sources

  1. Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI: 10.1038/nbt.3192
  2. Macosko, E. Z., Basu, A., Satija, R., Nemesh, J., Shekhar, K., Goldman, M., ... & McCarroll, S. A. (2015). Highly parallel genome-wide expression profiling of individual cells using nanoliter droplets. Cell, 161(5), 1202–1214. DOI: 10.1016/j.cell.2015.05.002

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis

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ScholarGateSingle-cell RNA-seq analysis (Single-cell RNA Sequencing Analysis). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/single-cell-rna-seq-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026