Analyse de la diversité du microbiome basée sur les réseaux

L'analyse de la diversité du microbiome basée sur les réseaux intègre l'inférence de réseaux de co-occurrence basés sur la théorie des graphes avec des métriques classiques de diversité alpha et bêta pour caractériser l'organisation structurelle des communautés microbiennes. Plutôt que de traiter les taxons comme des entités indépendantes, la méthode modélise les associations microbiennes par paires comme des arêtes dans un réseau, permettant l'identification de taxons clés, de modules communautaires et de schémas d'interaction écologique que les simples indices de diversité ne peuvent pas détecter.