Analyse phylogénétique basée sur les réseaux — Inférence de réseaux phylogénétiques

L'analyse phylogénétique basée sur les réseaux construit des représentations des relations évolutives structurées en graphes qui tiennent explicitement compte des événements réticulés — incluant l'hybridation, le transfert horizontal de gènes, la recombinaison et le tri incomplet des lignées — que les arbres phylogénétiques strictement bifurquants ne peuvent pas représenter. Au lieu de forcer les séquences dans un seul arbre bifurquant, la méthode infère les scissions ou les réticulations dans les données et les visualise sous forme de réseau, révélant des signaux phylogénétiques conflictuels qui sont biologiquement informatifs.