Analyse phylogénétique — Reconstruction d'arbres évolutifs à partir de données moléculaires

L'analyse phylogénétique reconstruit l'histoire évolutive des organismes, gènes ou protéines en comparant des données de séquences moléculaires et en estimant l'arbre de branchement qui explique le mieux les similarités et différences observées. Issue des travaux de Felsenstein et de ses collègues à partir des années 1960, elle est une technique fondamentale en biologie évolutive, microbiologie, épidémiologie et génomique comparative, soutenant des tâches allant de la traçabilité de l'origine des épidémies virales à la classification de nouvelles espèces.