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Process / pipelineBioinformatics / omics

Analyse multi-omique de cellules uniques par ARNm — Profilage multimodal intégré de cellules uniques

L'analyse multi-omique de cellules uniques par ARNm intègre deux couches moléculaires ou plus — telles que l'expression génique (scRNA-seq), l'accessibilité de la chromatine (scATAC-seq) ou l'abondance des protéines de surface (CITE-seq) — mesurées simultanément ou co-profilées dans les mêmes cellules individuelles. En alignant ces modalités dans un espace partagé de faible dimension, les chercheurs obtiennent une image mécanistiquement plus riche de l'identité cellulaire, de l'état réglementaire et du phénotype que ce que peut fournir un seul essai.

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Sources

  1. Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link
  2. Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis

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ScholarGateMulti-omics single-cell RNA-seq analysis (Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026