Analyse ATAC-seq
L'ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) est une méthode de profilage du paysage de l'accessibilité de la chromatine à l'échelle du génome. Développée par Buenrostro et ses collègues en 2013, l'ATAC-seq utilise une transposase hyperactive pour marquer les régions de chromatine ouvertes et accessibles, permettant une identification rapide et sensible des éléments d'ADN régulateurs. L'ATAC-seq est devenue une technique standard pour caractériser les paysages régulateurs des gènes, découvrir des éléments régulateurs spécifiques au type cellulaire et inférer des réseaux de régulation génique.
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Sources
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Comment citer cette page
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/genetics/atac-seq-analysis
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- Analyse Hi-CGénétique↔ compare
- Vitesse de l'ARNGénétique↔ compare
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