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Yapay Zekâ

112 Methoden in dieser Familie.

Ausgewählt

Leseweg

Die meistzitierten grundlegenden Methoden dieses Themas, in der Reihenfolge ihrer Entwicklung — ein Ausgangspunkt, wenn Sie hier neu sind.

  1. Analyse von Kopienzahlvariationen (CNV) – Erkennung und Interpretation von CNVs1998–2006von Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
  2. Pathway Enrichment Analysis2003–2005von Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
  3. Gen-Satz-Anreicherungsanalyse (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)von Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
  4. Genomweite Assoziationsstudie (GWAS)2005–2007von Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
  5. Epigenomweite Assoziationsstudie (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)von Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
  6. RNA-seq Differential Expression2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)von Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
  7. Einzelzell-RNA-seq-Analyse2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016von Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
  8. Varianten-Calling2009–2010 (modern high-throughput era)von Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)
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Admixture-AnalyseRekonstruktion des VorfahrenzustandsATAC-seq-AnalyseChIP-seq Peak CallingKoaleszenztheorieAnalyse von Kopienzahlvariationen (CNV) – Erkennung und Interpretation von CNVsCRISPR-Screen-AnalyseRekonstruktion mittels Kryo-EMDe-novo-Transkriptom-AssemblierungDifferenzielles ChIP-seq Peak CallingDifferential Copy Number Variation AnalysisDifferential Epigenome-Wide Association StudyDifferential eQTL AnalysisDifferential Metabolomics AnalysisDifferential Pathway Enrichment AnalysisDifferential Proteomics AnalysisDifferenzielle Einzelzell-RNA-seq-AnalyseDifferential Variant CallingEpigenomweite Assoziationsstudie (EWAS)Epigenomweite Assoziationsstudie in der BildungsforschungeQTL-AnalyseF-Statistiken (FST)GCTAGen-Satz-Anreicherungsanalyse (GSEA)Genomweite Assoziationsstudie (GWAS)Genomweite Assoziationsstudie in der BildungsforschungHi-C-AnalyseHKA-TestHMMER-ProfilsucheHomologiemodellierungIBD-MappingLD Block AnalyseMaschinelles Lernen-gestützte ChIP-seq Peak-DetektionMaschinelles Lernen-gestützte KopienzahlvariationsanalyseML-gestützte Epigenomweite Assoziationsstudie (ML-EWAS)Machine Learning-gestützte eQTL-AnalyseMaschinelles Lernen-gestützte Gen-Set-AnreicherungsanalyseML-GWAS (Machine Learning-Assisted Genome-Wide Association Study)Maschinelles Lernen-gestützte Metabolomik-AnalyseMaschinelles Lernen-gestützte Mikrobiom-DiversitätsanalyseMaschinelles Lernen-gestützte Pathway-AnalyseMaschinelles Lernen-gestützte phylogenetische AnalyseMachine learning-assisted RNA-seq differential expressionMaschinelles Lernen-gestützte SequenzalignmentsMaschinelles Lernen-gestützte Einzelzell-RNA-seq-AnalyseMaschinelles Lernen-gestützte Varianten-IdentifizierungMcDonald-Kreitman-TestMetabolomics AnalysisMetagenomische BinningMolekulardockingMulti-Omics Epigenome-Wide Association StudyMulti-Omics-eQTL-AnalyseMulti-Omics-Gen-Set-AnreicherungMulti-Omics-Metabolomik-AnalyseAnalyse der Diversität von Mikrobiomen mittels Multi-Omics-AnsätzenMulti-Omics Pathway-AnreicherungMulti-omics Phylogenetic AnalysisMulti-omics ProteomanalyseMulti-Omics-RNA-seq-Analyse differentieller ExpressionMulti-Omics-Single-Zell-RNA-seq-AnalyseNetzwerkbasierte Analyse von KopienzahlvariationenNetwork-basierte Epigenomweite Assoziationsstudie (Network EWAS)Netzwerkbasierte eQTL-AnalyseNetzwerkbasierte Genomweite AssoziationsstudienNetzwerkbasierte MetabolomanalyseNetzwerkbasierte Mikrobiom-DiversitätsanalyseNetzwerkbasierte Pathway-AnreicherungsanalyseNetzwerkbasierte phylogenetische AnalyseNetzwerkbasierte RNA-seq-Analyse differentieller ExpressionNetzwerkbasierte Analyse von Einzelzell-RNA-Seq-DatenNetzwerkbasierte VariantenaufrufungPathway Enrichment AnalysisPharmakophor-ModellierungPhylogenetische AnalysePhylogenetische unabhängige KontrastePolygener RisikoscorePPI-NetzwerktopologieProteomanalyseQSARQTL-MappingRNA VelocityRNA-seq Differential ExpressionSelection Sweep (Tajima's D)Sequenz-AlignmentPeak-Calling für Single-Cell-ChIP-seqEinzelzell-KopienzahlvariationsanalyseEinzelzell-Epigenom-weite Assoziationsstudie (scEWAS)Einzelzell-eQTL-AnalyseSingle-cell Gen-Set-Anreicherung – scGSEAEinzelzell-GWASEinzelzell-Metabolomik-AnalyseAnalyse der mikrobiellen Diversität auf EinzelzellebenePhylogenetische EinzelzellanalyseEinzelzell-RNA-seq-AnalyseDifferenzielle Expressionsanalyse von Einzelzell-RNA-seqEinzelzell-SequenzalignmentSingle-cell variant callingZeitreihen-ChIP-seq-Peak-Calling – Temporale Chromatin-ProfilierungZeitreihenanalyse von KopienzahlvariationenZeitreihen-Epigenomweite AssoziationsstudieZeitreihen-eQTL-AnalyseTime-series gene set enrichment analysisZeitreihen-MetabolomanalyseTime-series microbiome diversity analysisZeitreihen-Pathway-AnalyseZeitreihen-Phylogenetische AnalyseZeitreihen-Proteomik-AnalyseZeitreihen-RNA-seq-DifferentialexpressionTime-series single-cell RNA-seq analysisZeitreihen-Variantenanalyse – Longitudinale somatische MutationsdetektionTransmission Disequilibrium TestVarianten-Calling

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