Netzwerkbasierte Pathway-Anreicherungsanalyse

Die netzwerkbasierte Pathway-Anreicherungsanalyse integriert molekulare Interaktionsnetzwerke – Protein-Protein-Interaktionen, Signalwege oder Genregulationsnetzwerke – mit Omics-Messungen, um biologische Pfade zu identifizieren, die unter einer bestimmten Bedingung koordiniert verändert sind. Im Gegensatz zu klassischen Ansätzen der Überrepräsentation oder Gen-Set-Anreicherung, die Pfad-Gene als unabhängige Listen behandeln, propagiert diese Methodenfamilie Signale über Netzwerk-Kanten, erfasst die Topologie von Interaktionen und deckt dysregulierte Module auf, die bei einer Anreicherung von flachen Listen übersehen würden.