Analyse der mikrobiellen Diversität auf Einzelzellebene
Die Analyse der mikrobiellen Diversität auf Einzelzellebene löst die Zusammensetzung und funktionelle Heterogenität mikrobieller Gemeinschaften auf der Ebene einzelner Zellen oder Bakterien auf. Durch die Kombination von Einzelzell- oder Einzelbakterienisolierung mit Hochdurchsatzsequenzierung überwindet diese Pipeline den Mittelungseffekt der Bulk-Metagenomik und ermöglicht die Detektion seltener Stämme, intra-spezifischer Variationen und zellulärer Heterogenität innerhalb komplexer Mikrobiome wie dem Darm, der Mundhöhle oder Umweltproben.
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Quellen
- Kehe, J., Kulesa, A., Ortiz, A., Ackerman, C. M., Thakku, S. G., Sellers, D., Bhatt, S., ... & Blainey, P. C. (2019). Massively parallel screening of synthetic microbial communities. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(26), 12804-12809. link ↗
- Zheng, W., Zhao, S., Yin, Y., Zhang, H., Needham, D. M., Evans, E. D., Bhatt, S., ... & Bhatt, D. L. (2020). High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome. Science, 376(6597), eabm1483. link ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Resolution Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/single-cell-microbiome-diversity-analysis
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