RNA Velocity
RNA velocity ist eine computergestützte Methode, die den zukünftigen Entwicklungszustand einzelner Zellen aus Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten ableitet. Die 2018 von La Manno und Kollegen entwickelte RNA-velocity-Analyse misst die Richtung und Geschwindigkeit von Zellzustandsübergängen durch Analyse des Verhältnisses von ungespleißten zu gespleißten mRNA-Transkripten innerhalb einzelner Zellen. Dies ermöglicht die Vorhersage von Zelltrajektorien und Differenzierungspfaden, ohne dass zeitliche Probenahme oder Manipulation erforderlich sind, und liefert einzigartige Einblicke in Zellschicksalsentscheidungen während der Entwicklung und bei Krankheiten.
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Quellen
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/de/genetics/rna-velocity
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