Multi-Omics-Single-Zell-RNA-seq-Analyse — Integrative multimodale Single-Zell-Profilierung
Die Multi-Omics-Single-Zell-RNA-seq-Analyse integriert zwei oder mehr molekulare Schichten — wie Genexpression (scRNA-seq), Chromatinzugänglichkeit (scATAC-seq) oder Oberflächenproteinexpression (CITE-seq) — die gleichzeitig oder in denselben Einzelzellen profiliert werden. Durch die Ausrichtung dieser Modalitäten in einem gemeinsamen niedrigdimensionalen Raum erhalten Forscher ein mechanistisch reichhaltigeres Bild von Zellidentität, regulatorischem Zustand und Phänotyp, als es ein einzelner Assay liefern kann.
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Quellen
- Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. link ↗
- Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. link ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/multi-omics-single-cell-rna-seq-analysis
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