Netzwerkbasierte Mikrobiom-Diversitätsanalyse
Die netzwerkbasierte Mikrobiom-Diversitätsanalyse integriert die graphentheoretische Inferenz von Kookkurrenznetzwerken mit klassischen Alpha- und Beta-Diversitätsmetriken, um die strukturelle Organisation mikrobieller Gemeinschaften zu charakterisieren. Anstatt Taxa als unabhängige Entitäten zu behandeln, modelliert die Methode paarweise mikrobielle Assoziationen als Kanten in einem Netzwerk, was die Identifizierung von Schlüssel-Taxa, Gemeinschaftsmodulen und ökologischen Interaktionsmustern ermöglicht, die einfache Diversitätsindizes nicht erkennen können.
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Quellen
- Friedman, J., & Alm, E. J. (2012). Inferring correlation networks from genomic survey data. PLoS Computational Biology, 8(9), e1002687. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002687 ↗
- Faust, K., & Raes, J. (2012). Microbial interactions: from networks to models. Nature Reviews Microbiology, 10(8), 538–550. DOI: 10.1038/nrmicro2832 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Microbiome Diversity Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/network-based-microbiome-diversity-analysis
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