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Process / pipelineBioinformatics / omics

Maschinelles Lernen-gestützte Metabolomik-Analyse

Die maschinelles Lernen-gestützte Metabolomik-Analyse ist eine integrative bioinformatische Pipeline, die ungezielt oder gezielt Metabolitenprofilierung – mittels Massenspektrometrie oder NMR – mit überwachten und unüberwachten ML-Algorithmen koppelt, um Biomarker zu entdecken, Phänotypen zu klassifizieren und metabolische Zustände zu modellieren. Durch die Bewältigung der extremen Dimensionalität und Kollinearität, die Metabolomik-Datensätzen inhärent sind (Hunderte bis Tausende von Merkmalen, Zehn- bis Hunderte von Proben), extrahieren ML-Methoden wie Random Forests, Support Vector Machines und Neuronale Netze biologisch interpretierbare Muster, die klassische univariate Statistiken routinemäßig übersehen.

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Quellen

  1. Liebal, U. W., Phan, A. N. T., Sudhakar, M., Raman, K., & Blank, L. M. (2020). Machine learning applications for mass spectrometry-based metabolomics. Metabolites, 10(6), 243. DOI: 10.3390/metabo10060243
  2. Bylesjö, M., Rantalainen, M., Cloarec, O., Nicholson, J. K., Holmes, E., & Trygg, J. (2006). OPLS discriminant analysis: combining the strengths of PLS-DA and SIMCA classification. Journal of Chemometrics, 20(8-10), 341-351. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Machine Learning-Assisted Metabolomics Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/machine-learning-assisted-metabolomics-analysis

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ScholarGateMachine learning-assisted metabolomics analysis (Machine Learning-Assisted Metabolomics Analysis). Abgerufen am 2026-06-15 von https://scholargate.app/de/bioinformatics/machine-learning-assisted-metabolomics-analysis · Datensatz: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026