Zeitreihen-RNA-seq-Differentialexpression — Temporale Transkriptomik

Die differentielle Expressionsanalyse von Zeitreihen-RNA-seq identifiziert Gene, deren Expressionslevel sich systematisch über geordnete Zeitpunkte hinweg ändern — wie während der Entwicklung, des Krankheitsverlaufs oder der Reaktion auf eine Behandlung. Im Gegensatz zur Zweikonditionen-DE-Analyse modelliert sie explizit die zeitliche Struktur der Daten und erfasst dynamische Genexpressionsverläufe anstelle eines einzelnen Schnappschusskontrasts. Speziell für dieses Design wurden Werkzeuge wie maSigPro, ImpulseDE2 und splineTimeR entwickelt.