GCTA
GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) ist ein computergestütztes Werkzeug zur Schätzung der Heritabilität und genetischer Korrelationen aus genomweiten Genotyp- und Phänotypdaten. GCTA wurde 2011 von Yang und Visscher entwickelt und verwendet die genomweite eingeschränkte Maximum-Likelihood-Methode (GREML), um die phänotypische Varianz in Komponenten zu zerlegen, die durch gemeinsame SNPs, Umweltfaktoren und Restvarianz erklärt werden. GCTA ist zu einem Standardwerkzeug geworden, um den Anteil der Merkmalsvarianz zu verstehen, der auf Genetik bei komplexen Krankheiten und quantitativen Merkmalen zurückzuführen ist.
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Quellen
- Yang, J., Lee, S. H., Goddard, M. E., & Visscher, P. M. (2011). GCTA: A tool for genome-wide complex trait analysis. American Journal of Human Genetics, 88(1), 76–82. DOI: 10.1016/j.ajhg.2010.11.011 ↗
- Zhou, X., Stephens, M. (2012). Genome-wide efficient mixed-model analysis for association studies. Nature Genetics, 44(7), 821–824. DOI: 10.1038/ng.2310 ↗
- Pitchford, W. S., & Brown, W. M. (2019). Genomic prediction and selection of genomic variance. Genetics Selection Evolution, 51(1), 53–66. link ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Genome-wide Complex Trait Analysis for Heritability Estimation. ScholarGate. https://scholargate.app/de/genetics/gcta
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