Process / pipelineEpigenomics

ATAC-seq-Analyse

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) ist eine Methode zur Profilierung der Genom-weiten Chromatinoffenheit. Entwickelt von Buenrostro und Kollegen im Jahr 2013, verwendet ATAC-seq eine hyperaktive Transposase, um offene, zugängliche Chromatinregionen zu markieren, was eine schnelle und sensitive Identifizierung regulatorischer DNA-Elemente ermöglicht. ATAC-seq ist zu einer Standardtechnik geworden, um genregulatorische Landschaften zu charakterisieren, zelltypspezifische regulatorische Elemente zu entdecken und genregulatorische Netzwerke abzuleiten.

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Quellen

Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗

So zitieren Sie diese Seite

ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/de/genetics/atac-seq-analysis

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