Differenzielle Einzelzell-RNA-seq-Analyse

Die differenzielle Einzelzell-RNA-seq (scRNA-seq)-Analyse ist eine computergestützte Pipeline, die transkriptomische Profile über biologische Bedingungen hinweg vergleicht – wie behandelt versus unbehandelt, krank versus gesund oder Zeitpunkte – auf Einzelzellauflösung. Sie identifiziert, welche Gene, Zelltypen und Zellzustände sich zwischen den Bedingungen ändern, und liefert mechanistische Einblicke, die Bulk-RNA-seq-Vergleiche nicht bieten können. Der Ansatz kombiniert Clustering, Zelltyp-Annotation und statistische Tests, wobei typischerweise eine Pseudobulk-Aggregation verwendet wird, um die Korrelation innerhalb der Probe zu berücksichtigen.