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Maschinelles Lernen-gestützte Pathway-Analyse

Die maschinelles Lernen-gestützte Pathway-Analyse integriert klassische statistische Pathway-Analyse-Methoden – wie die Over-Representation Analysis oder die Gene Set Enrichment Analysis – mit Algorithmen des maschinellen Lernens, um die Sensitivität zu verbessern, hochdimensionale Omics-Daten zu verarbeiten und nicht-lineare biologische Muster aufzudecken. Der Ansatz geht über die reine Rangfolge von Pathways nach p-Wert hinaus, indem er ML-Modelle verwendet, um Genbeiträge zu gewichten, Signal von Rauschen über viele Proben hinweg zu unterscheiden und biologisch bedeutsame Pathways in komplexen Datensätzen zu priorisieren.

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Gen-Satz-Anreicherungsan…Random Forest

Quellen

  1. Chen, E. Y., Tan, C. M., Kou, Y., Duan, Q., Wang, Z., Meirelles, G. V., Clark, N. R., & Ma'ayan, A. (2013). Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool. BMC Bioinformatics, 14, 128. link
  2. Way, G. P., & Greene, C. S. (2018). Extracting a biologically relevant latent space from cancer transcriptomes with variational autoencoders. Pacific Symposium on Biocomputing, 23, 80–91. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Machine Learning-Assisted Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/machine-learning-assisted-pathway-enrichment-analysis

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ScholarGateMachine learning-assisted pathway enrichment analysis (Machine Learning-Assisted Pathway Enrichment Analysis). Abgerufen am 2026-06-15 von https://scholargate.app/de/bioinformatics/machine-learning-assisted-pathway-enrichment-analysis · Datensatz: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026