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Netzwerkbasierte Genomweite Assoziationsstudien — Netzwerkbasierte Genomweite Assoziationsstudie

Netzwerkbasierte Genomweite Assoziationsstudien integrieren konventionelle Genomweite Assoziationsstudien-Ergebnisse mit biologischen Netzwerkdaten — wie Protein-Protein-Interaktionsnetzwerken (PPI) oder Gen-Koexpressionsgraphen —, um krankheitsrelevante Genmodule oder Subnetzwerke zu identifizieren. Anstatt nur die Top-Einzel-SNPs zu berichten, propagiert dieser Ansatz Assoziationssignale durch molekulare Interaktionsnetzwerke und deckt Gencluster auf, deren kollektives Signal sie für die komplexe Merkmalsbiologie impliziert, auch wenn keine einzelne Variante allein die genomweite Signifikanz erreicht.

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Quellen

  1. Wang, Q., Yu, H., Zhao, Z., & Jia, P. (2015). EW_dmGWAS: edge-weighted dense module search for genome-wide association studies and gene expression profiles. Bioinformatics, 31(15), 2591–2594. link
  2. Leiserson, M. D. M., Vandin, F., Wu, H.-T., Dobson, J. R., Eldridge, J. V., Thomas, J. L., Papoutsaki, A., Kim, Y., Niu, B., McLellan, M., Lawrence, M. S., Gonzalez-Perez, A., Tamborero, D., Cheng, Y., Ryslik, G. A., Lopez-Bigas, N., Getz, G., Ding, L., & Raphael, B. J. (2015). Pan-cancer network analysis identifies combinations of rare somatic mutations contributing to tumorigenesis. Nature Genetics, 47(2), 106–114. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Genome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/network-based-gwas

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ScholarGateNetwork-based GWAS (Network-based Genome-Wide Association Study). Abgerufen am 2026-06-15 von https://scholargate.app/de/bioinformatics/network-based-gwas · Datensatz: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026