Zeitreihen-Phylogenetische Analyse — Temporale Phylogenetik
Die zeitreihen-phylogenetische Analyse rekonstruiert die Evolutionsgeschichte von Organismen oder genetischen Varianten anhand von Sequenzen, die zu bekannten Zeitpunkten entnommen wurden. Durch die direkte Einbeziehung von Entnahmedaten in das Modell schätzt sie Divergenzzeiten, Substitutionsraten und Vorfahrenbeziehungen auf einer absoluten Zeitskala – was sie für die Untersuchung von Virusaustritten, der Dynamik alter DNA und der schnellen mikrobiellen Evolution unerlässlich macht.
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Quellen
- Drummond, A. J., & Rambaut, A. (2007). BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees. BMC Evolutionary Biology, 7, 214. DOI: 10.1186/1471-2148-7-214 ↗
- Bouckaert, R., Vaughan, T. G., Barido-Sottani, J., Duchene, S., Fourment, M., Gavryushkina, A., et al. (2019). BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Computational Biology, 15(4), e1006650. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1006650 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Phylogenetic Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/time-series-phylogenetic-analysis
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