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Zeitreihen-eQTL-Analyse — Dynamische genetische Regulation der Genexpression

Die Zeitreihen-eQTL-Analyse identifiziert genetische Varianten (eQTLs), deren Einfluss auf die Genexpression sich über die Zeit oder Entwicklungsstadien hinweg ändert. Durch die Kombination von longitudinalen RNA-seq-Daten mit individuellen Genotypen erfasst die Methode, wie dasselbe SNP zu verschiedenen Zeitpunkten die Genregulation aktivieren, stilllegen oder umgestalten kann – und enthüllt so die zeitliche Architektur des regulatorischen Programms des Genoms bei Prozessen wie Differenzierung, Krankheitsverlauf und Umweltreaktion.

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Quellen

  1. Fair, B. J., et al. (2020). Gene expression variability in human and chimpanzee populations share common determinants. eLife, 9, e59929. link
  2. Strober, B. J., et al. (2019). Dynamic genetic regulation of gene expression during cellular differentiation. Science, 364(6447), 1287–1290. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis

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ScholarGateTime-series eQTL analysis (Time-series Expression Quantitative Trait Loci Analysis). Abgerufen am 2026-06-15 von https://scholargate.app/de/bioinformatics/time-series-eqtl-analysis · Datensatz: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026