Differential Proteomics Analysis — Vergleich von Proteinexprimierung über verschiedene Bedingungen hinweg
Differential Proteomics Analysis ist eine quantitative Pipeline, die Proteine identifiziert, deren Expressionslevel zwischen zwei oder mehr biologischen Bedingungen – wie gesundem versus krankem Gewebe, behandelten versus unbehandelten Zellen oder verschiedenen Entwicklungsstadien – signifikant variieren. Durch die Kombination von massenspektrometrischer Detektion mit statistischen Tests generiert die Methode Ranglisten differenziell exprimierter Proteine, die mit biologischen Signalwegen, Krankheitsmechanismen oder Zielstrukturen von Medikamenten in Verbindung gebracht werden können.
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Quellen
- Ong, S.-E., Blagoev, B., Kratchmarova, I., Kristensen, D. B., Steen, H., Pandey, A., & Mann, M. (2002). Stable isotope labeling by amino acids in cell culture, SILAC, as a simple and accurate approach to expression proteomics. Molecular & Cellular Proteomics, 1(5), 376–386. DOI: 10.1074/mcp.M200025-MCP200 ↗
- Bantscheff, M., Lemeer, S., Savitski, M. M., & Kuster, B. (2012). Quantitative mass spectrometry in proteomics: critical review update from 2007 to the present. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 404(4), 939–965. DOI: 10.1007/s00216-012-6203-4 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Differential Proteomics Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/differential-proteomics-analysis
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