Einzelzell-Epigenom-weite Assoziationsstudie (scEWAS)
Eine Einzelzell-Epigenom-weite Assoziationsstudie (scEWAS) untersucht epigenetische Merkmale – hauptsächlich DNA-Methylierung oder Chromatinzugänglichkeit – über das gesamte Genom mit Einzelzellauflösung und assoziiert dann statistisch die Variation dieser Merkmale mit einem Phänotyp, einer Krankheit oder einer Exposition. Indem sie die Zelltyp-Heterogenität auflöst, die eine Bulk-EWAS nicht trennen kann, identifiziert die scEWAS epigenetische Signale, die spezifisch für seltene oder vermischte Zellpopulationen sind, anstatt über Gewebe gemittelt zu werden.
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Quellen
- Zhang, Y., et al. (2022). Single-cell epigenome analysis reveals age-associated decay of heterochromatin domains in excitatory neurons in the mouse brain. Cell Research, 32(1), 1-18. link ↗
- Aryee, M. J., et al. (2014). Minfi: a flexible and comprehensive Bioconductor package for the analysis of Infinium DNA methylation microarrays. Bioinformatics, 30(10), 1363-1369. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu049 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Epigenome-Wide Association Study. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/single-cell-epigenome-wide-association-study
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