Zeitreihen-Gen-Set-Anreicherung (Time-Series Gene Set Enrichment Analysis, TS-GSEA) — Dynamische Pathway-Anreicherung über Zeitpunkte hinweg
Die Zeitreihen-Gen-Set-Anreicherung (TS-GSEA) erweitert den klassischen GSEA-Rahmen, um biologisch koordinierte Gen-Sets – Pathways, Gene Ontology-Begriffe oder kuratierte Signaturen – zu erkennen, deren kollektive Expression sich über die Zeit sinnvoll ändert. Anstatt zwei Momentaufnahmen zu vergleichen, modelliert sie die gesamte zeitliche Trajektorie der Genexpression, um zu identifizieren, welche funktionellen Programme während eines biologischen Prozesses wie Entwicklung, Ansprechen auf Behandlung oder Krankheitsfortschritt aktiviert, unterdrückt oder dynamisch umgestaltet werden.
Die vollständige Methode lesen
Melden Sie sich mit einem kostenlosen Konto an, um diesen Abschnitt zu lesen.
Methodenkarte
Die Nachbarschaft verwandter Methoden — wählen Sie einen Knoten, um sie zu erkunden.
Quellen
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
So zitieren Sie diese Seite
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/de/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
Welche Methode?
Stellen Sie diese Methode neben ihre nächsten Verwandten und lesen Sie sie nebeneinander — die Bibliothek legt die Bücher auf den Tisch; die Wahl liegt bei Ihnen.
- Gen-Satz-Anreicherungsanalyse (GSEA)Bioinformatik↔ vergleichen
- Multi-Omics-Gen-Set-AnreicherungBioinformatik↔ vergleichen
- Pathway Enrichment AnalysisBioinformatik↔ vergleichen
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ vergleichen
- Einzelzell-RNA-seq-AnalyseBioinformatik↔ vergleichen
- Zeitreihen-RNA-seq-DifferentialexpressionBioinformatik↔ vergleichen
Similar methods
Einen Fehler auf dieser Seite entdeckt? Melden oder Korrektur vorschlagen →