Yapay Zekâ

112 metoder i denne familien.

Utvalgte

AdskillelsesanalyseAdmixture analysis is a population genetics method that infers population structure and individual ancestry from multilocus genotype data. Originally developed by Pritchard, Stephe Tilbakeføring av stamfartilstandAncestral state reconstruction (ASR) is a phylogenetic method that infers the character states (trait values or evolutionary features) of extinct ancestors by analyzing patterns of ATAC-seq-analyseATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) is a method for profiling the landscape of chromatin accessibility genome-wide. Developed by Buenrostro and c ChIP-seq Peak CallingChIP-seq peak calling is a computational pipeline that identifies genomic regions where a protein of interest — a transcription factor or histone modification — is enriched, based KoalescensteoriCoalescent theory is a probabilistic framework that traces the genealogical history of DNA sequences backward in time to their most recent common ancestor. Developed by John Kingma Analyse av kopiantallsvariasjonCopy number variation (CNV) analysis is a genomic pipeline for detecting regions where individuals carry fewer or more copies of a DNA segment than the reference genome. CNVs span

Lesesti

Dette emnets mest refererte grunnleggende metoder, i den rekkefølgen de ble utviklet — et sted å begynne hvis du er ny her.

Analyse av kopiantallsvariasjon1998–2006av Pinkel et al. (array CGH); Redon et al. (genome-wide CNV map)
Pathway Enrichment Analysis2003–2005av Mootha et al. (2003); systematised by Subramanian et al. (2005)
Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)2005 (seminal PNAS paper; predecessor concept in Mootha et al. 2003)av Aravind Subramanian, Pablo Tamayo, Vamsi K. Mootha, Jill P. Mesirov, Todd R. Golub, Eric S. Lander et al. (Broad Institute)
Genom-omfattende assosiasjonsstudie (GWAS)2005–2007av Klein et al. (age-related macular degeneration GWAS, 2005); landmark scale: Wellcome Trust Case Control Consortium (2007)
Epigenom-vid assosiasjonsstudie (EWAS)2008–2011 (term and framework established c. 2011)av Rakyan, Down, Balding & Beck (conceptual framework); Illumina arrays enabled large-scale application
RNA-seq differensialuttrykk2008–2010 (RNA-seq DE methodology established)av Multiple groups; foundational methods from Anders & Huber (DESeq, 2010), Robinson, McCarthy & Smyth (edgeR, 2010)
Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)2009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016av Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
Variant Calling2009–2010 (modern high-throughput era)av Li et al. (SAMtools/bcftools, 2009); McKenna et al. (GATK, 2010)

alle metoder på denne hyllen ↓

Alle metoder 112

Adskillelsesanalyse Tilbakeføring av stamfartilstand ATAC-seq-analyse ChIP-seq Peak Calling Koalescensteori Analyse av kopiantallsvariasjon CRISPR-skjermanalyse Rekonstruksjon med kryo-EM De Novo Transkriptommontering Differensiell ChIP-seq Peak Calling Analyse av differensial kopitallsvariasjon Differensiell Epigenom-Vid Assosiasjonsstudie Differensiell eQTL-analyse Differensiell metabolomikkanalyse Differensiell banearbeidsanalyse Differensiell proteomikk-analyse Differensiell encelle-RNA-sekvenseringsanalyse Differensiell variantkalling Epigenom-vid assosiasjonsstudie (EWAS)Epigenomdekkende assosiasjonsstudie i utdanningsforskning eQTL-analyse F-statistikk (FST)GCTA Genesettanrikelsesanalyse (GSEA)Genom-omfattende assosiasjonsstudie (GWAS)Genom-vid assosiasjonsstudie i utdanningsforskning Hi-C-analyse HKA-testen HMMER-profilsøk Homologimodellering IBD-kartlegging LD Block-analyse Maskinlæringsassistert ChIP-seq toppkalling Maskinlæringsassistert analyse av kopitallsvariasjoner Maskinlæringsassistert epigenom-vid utbredelsesstudie (ML-EWAS)Maskinlæringsassistert eQTL-analyse Maskinlæringsassistert gen-sett-anrikningsanalyse Maskinlæringsassistert GWAS Maskinlæringsassistert metabolomikk-analyse Maskinlæringsassistert analyse av mikrobiomdiversitet Maskinlæringsassistert berikelsesanalyse av signalveier Maskinlæringsassistert fylogenetisk analyse Maskinlæringsassistert RNA-seq differensialuttrykksanalyse Maskinlæringsassistert sekvensjustering Maskinlæringsassistert analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering Maskinlæringsassistert variantkalling McDonald-Kreitman-testen Metabolomanalyse Metagenomisk binning Molekylær docking Multi-Omics Epigenome-Wide Association Study Multi-omics eQTL-analyse Multi-omics gen-settberikningsanalyse Multi-omics metabolomics analysis Multi-omikk mikrobiomdiversitetsanalyse Multi-omikk-anrikning av biologiske veier Fylogenomikk med flere omics-lag Multi-omikk-proteomikkanalyse Multi-omikk RNA-seq differensiell uttrykksanalyse Analyse av multiomikk-data fra enkeltceller Nettverksbasert analyse av kopitallsvariasjoner Nettverksbasert Epigenom-vid Assosiasjonsstudie (Network EWAS)Nettverksbasert eQTL-analyse Nettverksbasert GWAS Nettverksbasert metabolomikkanalyse Nettverksbasert analyse av mikrobiomdiversitet Nettverksbasert berikelsesanalyse av signalveier Nettverksbasert fylogenetisk analyse Nettverksbasert RNA-seq analyse av differensiell ekspresjon Nettverksbasert analyse av enkeltcelle-RNA-seq Nettverksbasert variantkalling Pathway Enrichment Analysis Farmakofor-modellering Fylogenetisk analyse Fylogenetiske uavhengige kontraster Genetisk risikoskår (Polygenic Risk Score, PRS)PPI-nettverkstopologi Proteomikk-analyse QSAR QTL-kartlegging RNA Velocity RNA-seq differensialuttrykk Seleksjonssveip (Tajimas D)Sekvensjustering Toppkalling for encelle-ChIP-seq – epigenomisk profilering med scChIP-seq Analyse av enkeltcelle kopitallsvariasjon Single-cell epigenome-wide association study (scEWAS)Single-cell eQTL-analyse Enkeltcelle-genberikelsesanalyse Enkeltcelle-GWAS Analyse av enkeltcellemetabolomikk Analyse av mangfold i enkeltcelle-mikrobiom Encelle-fylogenetisk analyse Analyse av enkeltcelle-RNA-sekvensering (scRNA-seq)Analyse av differensial genuttrykk i enkeltcelle-RNA-sekvensering Enkeltcelle sekvensjustering Enkeltcelle-variantkalling Tidsserie-ChIP-seq-toppkalling Tidsrekkeanalyse av kopitallsvariasjon Tidsrekke epigenom-vid assosiasjonsstudie Tidsrekke-eQTL-analyse Tidsrekke-genmengdeberikelsesanalyse – Dynamisk vei-berikelse over tidspunkter Tidsrekkeanalyser i metabolomikk Tidsrekkeanalyse av mikrobiomdiversitet Tidsrekke-anrikningsanalyse av signalveier Tidsrekke-fylogenetisk analyse Tidsrekke-proteomanalyse Tidsrekke RNA-seq Differensiell Ekspresjon Tidsrekkeanalyse av enkeltcelle-RNA-seq Tidsserie-variantkalling – deteksjon av longitudinelle somatiske mutasjoner Transmission Disequilibrium Test Variant Calling

Mer i Livsvitenskap

İstatistik 21 Karar Bilimleri 7 Ölçme & Psikometri 122 Nedensellik & Kanıt 1