ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Toppkalling for encelle-ChIP-seq – epigenomisk profilering med scChIP-seq

Toppkalling for encelle-ChIP-seq er en bioinformatikk-pipeline som identifiserer genomiske regioner anriket for histonmodifikasjoner eller transkripsjonsfaktorbinding i individuelle celler. Ved å profilere kromatin-tilstander med encelleoppløsning, avslører den epigenomisk heterogenitet som er skjult i bulk-ChIP-seq-eksperimenter, noe som gjør det mulig for forskere å kartlegge regulatoriske landskap på tvers av distinkte cellepopulasjoner innenfor en kompleks vevsprøve.

Åpne i MethodMindSnartVideoSnartLast ned lysbilder

Les hele metoden

Kun for medlemmer

Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.

Logg inn

Metodekart

Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.

Kilder

  1. Grosselin, K., Durand, A., Marsolier, J., Poitou, A., Marangoni, E., Nemati, F., ... & Vallot, C. (2019). High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer. Nature Genetics, 51(6), 1060-1066. link
  2. Ku, W. L., Nakamura, K., Gao, W., Cui, K., Hu, G., Tang, Q., ... & Zhao, K. (2019). Single-cell chromatin immunocleavage sequencing (scChIC-seq) to profile histone modification. Nature Methods, 16(4), 323-325. link

Slik siterer du denne siden

ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling

Hvilken metode?

Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.

Sammenlign side om side
ScholarGateSingle-cell ChIP-seq peak calling (Single-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Hentet 2026-06-15 fra https://scholargate.app/no/bioinformatics/single-cell-chip-seq-peak-calling · Datasett: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026