PPI-nettverkstopologi
Analyse av protein-protein-interaksjonsnettverk (PPI) identifiserer og karakteriserer de strukturelle egenskapene til cellulære interaksjonsnettverk. Denne tilnærmingen, som ble banebrytende av Uetz og kolleger gjennom storskala gjær-tohybrid-screening, avslører topologiske trekk som "hubs", moduler og motiver som koder for funksjonell organisering og sykdomsassosiasjoner.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Metodekart
Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.
Kilder
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/ppi-network-topology
Hvilken metode?
Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.
- Rekonstruksjon med kryo-EMBioinformatikk↔ sammenlign
- HMMER-profilsøkBioinformatikk↔ sammenlign
- Molekylær dockingBioinformatikk↔ sammenlign
Referert av
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →