HKA-testen
Hudson-Kreitman-Aguade (HKA)-testen er en statistisk metode som tester for nøytral evolusjon ved å sammenligne nivåer av polymorfisme innenfor populasjoner og divergens mellom populasjoner på tvers av flere loci. Testen ble utviklet av Hudson, Kreitman og Aguade i 1987 og bruker prinsippet om at nøytrale loci skal vise forventede sammenhenger mellom polymorfisme og divergens. Loci som avviker fra disse sammenhengene, er kandidater for seleksjon. HKA-testen er spesielt nyttig for å påvise seleksjon i genomsveipende undersøkelser fordi den bruker relative sammenligninger på tvers av loci, snarere enn å kreve ekstern kalibrering.
Les hele metoden
Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Kilder
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Slik siterer du denne siden
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/no/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- KoalescensteoriGenetikk↔ compare
- F-statistikk (FST)Genetikk↔ compare
- McDonald-Kreitman-testenGenetikk↔ compare
- Seleksjonssveip (Tajimas D)Genetikk↔ compare
Referert av
Funnet en feil på denne siden? Rapporter eller foreslå en rettelse →