ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Tidsrekkeanalyse av enkeltcelle-RNA-seq — Temporal transkriptomikk med enkeltcelleoppløsning

Tidsrekkeanalyse av enkeltcelle-RNA-seq fanger genuttrykk på tvers av flere tidspunkter med enkeltcelleoppløsning for å avdekke hvordan cellepopulasjoner oppstår, skifter og divergerer under dynamiske biologiske prosesser som utvikling, differensiering eller sykdomsprogresjon. Ved å kombinere pseudotidsordning, RNA-hastighet og testing av differensiell dynamikk, rekonstruerer forskere den temporale banen til individuelle celler og identifiserer genregulatoriske endringer som driver biologiske overganger.

Åpne i MethodMindSnartApply, compare, get guidance
Tools & resources
Last ned lysbilder
Learn & explore
VideoSnart

Les hele metoden

Kun for medlemmer

Logg inn med en gratis konto for å lese denne delen.

Logg inn

Metodekart

Nabolaget av beslektede metoder — velg en node for å utforske.

Kilder

  1. Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859
  2. La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6

Slik siterer du denne siden

ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/no/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis

Hvilken metode?

Sett denne metoden ved siden av sin nærmeste slektning og les dem side om side — biblioteket legger bøkene på bordet; valget er ditt.

Sammenlign side om side

Referert av

ScholarGateTime-series single-cell RNA-seq analysis (Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis). Hentet 2026-06-17 fra https://scholargate.app/no/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis · Datasett: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026